[検索]-[監視設定]-[検索ノード登録]からのノードを登録する際に、「VMware ノード登録」を無効にすることで VM_GUEST の自動登録を行いません。
個別に VM_GUEST を登録する場合には、「検索結果一覧」画面の「VMware ノード一覧」から適切なプライオリティを設定して検索ください。